Membre fondateur de la Société anatomique de Paris, Achille Comte abandonne rapidement la carrière médicale pour se lancer dans l’enseignement et la vulgarisation. Il est l'auteur de très nombreux ouvrages destinés à l'enseignement de l'histoire naturelle pour les collèges et les écoles normales primaires, ainsi que des ouvrages d’anatomie ou de physiologie.
Inspiré par l’anatomie clastique du docteur Louis Auzoux (qui avait réalisé des modèles anatomiques démontables en papier mâché), Achille Comte est le premier à introduire des planches à figures découpées et superposées dans ses ouvrages d’anatomie. Son exemple sera suivi dans la deuxième moitié du siècle par beaucoup d’autres.